Prática extra!!!!

Olá Pessoal,

Estamos planejando algumas aulas práticas extras, exclusivamente com a finalidade de treinar focalização. Nesta aula teremos apenas um fungo e uma bactéria para que vocês treinem a focalização de ambos. Para cada 2 turmas haverá uma hora de aula extra, os horários estão abaixo:

Turma de Quarta das 14:00 as 15:50 e das 16:00 as 17:50 - aula extra: Quarta dia 18, das 18:00 as 19:00

Turma de Quinta das 8:00 as 9:50 e das 10:00 as 11:50 - aula extra: Terça dia 17, das 12:30 as 13:30

Turma de Quinta das 14:00 as 15:50 e das 16:00 as 17:50 - aula extra: Quinta dia 19, das 12:30 as 13:30

Todas as turmas de Sexta - aula extra: Sexta dia 20, das 12:30 as 13:30

Todos os alunos que querem treinar focalização nas aulas extras devem dar seu nome aqui no blog (nome completo, dia e hora que irá na aula extra) ou então dar o nome nas listas que passarão nas aulas práticas nesta

semana. Relembrando que a aula extra visará somente o treino de focalização e teremos 

disponíveis apenas um fungo e uma bactéria. NÃO REVISAREMOS MÉTODOS DE PREPARO DE LÂMINAS E MORFOLOGIA DOS MICRORGANISMOS*

Qualquer dúvida deixem seus comentários!

Até a próxima!

Raphael/Aranha

Resultado da pesquisa sobre Archaea

Olá pessoal

segue abaixo a lista dos alunos que apresentaram pesquisa sobre as características de arqueas. Para simplificar, dividimos na seguinte categorias:

- OK.  Ficou legal e foi pontuado
- alguns conceitos errados, mas ok - pontuado. Mas estes não serão mais pontuados no futuro!!!
- muito incompleto/não pontuou. A pesquisa não estava detalhada o suficiente, como solicitado.
- errado, não pontuou. Prevaleceu conceitos errados e incompletos.
- cópia literal, não pontuou. Foi feito um copy-paste de algum site. Assim não vale.
-fora do prazo/invalidado. Motivo óbvio.

Notem que alguns não puderam ser identificados (marcados com ???). Assim, não podemos pontuar caso não se identifiquem. Os que enviaram para meu email (Aranha) não estão nesta lista e receberão um email com o resultado. Nas próximas pesquisas, não aceitaremos mais textos enviados para  emails.

abraços e até a prova

Aranha e Raphael

Nome		consideração
Aimee Regali Seleghim		errado/não pontuou
Albert K. Hirose		muito incompleto/não pontuou
Alexandre Granado Vaz		OK
Aline Pereira da Silva		OK
Amadeus Zanetini		OK
Amanda Fernandes Franci		OK
Amanda Gilabel		alguns conceitos errados mas OK
Amanda Olbrick Marabesi		alguns conceitos errados mas OK
Amarilis Thieme Shiroma		OK
Ana Laura Bodoni da Rocha		OK
André Kobayashi		muito incompleto/não pontuou
Antonio Donadeli Neto		muito incompleto/não pontuou
Arthur		OK
Artur Ortenblad		OK
Barbara C. Vido Pereira		OK
Betânia		OK
Breno do Nascimento		OK
Bruna Garbatti Factor		OK
Bruno de Faria Baricelli		OK
Bruno de Lima Martins		OK
Bruno J. Laurentiz		muito incompleto/não pontuou
Bruno Satollo		OK
Carla Massarato		muito incompleto/não pontuou
Carlos D. G. Silva		muito incompleto/não pontuou
Carol Picinni		OK
Carolina Kravets		OK
Consultoria Ambiental	?????	OK, mas quem é você?
Daniel Oyan		OK
Daniele Tavoni		OK
Diandra		OK
Diane R. Tavares		OK
Diogo Nl	???	OK, who are you?
Eduardo Marques		OK
Eduardo Ribeiro Garcia		OK
Érica Donaire da Silva		OK
Everton barbosa		alguns conceitos errados mas OK
Fabiana Forte		OK
Fabiana S. Quaggio		OK
Fábio Visses		OK
Felipe Moraes Ribeiro Bozza		OK
Felipe Najim barbeiro		muito incompleto/não pontuou
Fernanda Dezani		OK
Filipe Ferreira		OK
Fredericko Baraldi		OK
Gabriel Ramos Vilela		muito incompleto/não pontuou
Gabriela Fancetto Juliano		alguns conceitos errados mas OK
Gabriela Souza		alguns conceitos errados mas OK
Giovana Lima		OK
Giovana Simão Slazon		muito incompleto/não pontuou
Giovani Casagrande Silvello		OK
Giovanna Marostegan Bego		OK
Gressa Amanda Chinelato		OK
Guilherme fachini		alguns conceitos errados mas OK
Guilherme Horak		OK
Gustavo Bortolotti Barbosa		OK
Gustavo de Castro Carvalho		OK
Gustavo de fausto martins		OK
Gustavo Takeshi Hacimoto		OK
Helder Beltrame		OK
Helena Arthuso		alguns conceitos errados mas OK
Henrique André Neves		OK
Henrique barbieri		muito incompleto/não pontuou
Henrique Sanches Gonçalves		errado
Isabella Cardoso Ferreira da Silva		alguns conceitos errados mas OK
Isadora Rodrigues		OK
Ivan Henrique Chagas		alguns conceitos errados mas OK
Jessica Fernanda da Silva		alguns conceitos errados mas OK
Jessica Thais de Lira Bazzetto		OK
João Carlos M. Freitas		Ok
José Augusto Sartory		OK
juliana Duarte		OK
Juliana Guardia		OK
Karen		OK
Karina Souza		muito incompleto/não pontuou
Larissa Chamma		OK
Larissa Costa Santos		Cópia literal/Fora do prazo/invalidado
Larissa Larocca de Souza		alguns conceitos errados mas OK
Larrisa Chamma		alguns conceitos errados mas OK
Laura Helena Porcari Simões		Ok
Leonardo Vianna Costa		OK
Leticia Cobello		OK
Letícia Krauspenhar Gervinski		OK
Liscia Akemi Adati		OK
Livia Brigliadori		OK
Lucas Finardi Christofoletti		OK
Lucas guilguer		alguns conceitos errados mas OK
Lucas Hebling Bosso		alguns conceitos errados mas OK
Luis Felipe Xavier Carvalho		muito incompleto/não pontuou
Luis Gustavo Mendes		OK
Luis Victor Costa Perazolo		alguns conceitos errados mas OK
Luiz Henrique Freguglia Aiello		OK
Luiz Henrique Zanin Weber		OK
Lygia Gago Miolaro		OK
Maiara Maria Franzoni		OK
Marcello Grisolia Giorgetti		OK
Marcelo	???	alguns conceitos errados mas OK. Quem é vc?
Marcos Buscariolo		OK
Marcos Henrique Feresin Gomes		alguns conceitos errados mas OK
Marcos Victor Santos Mendes		OK
Maria Izabel		OK
Marina Coan Goldoni Baribieri		alguns conceitos errados mas OK
Mateus C. Pereira		OK
Mateus Nishimura Narazaki		OK
Mateus Vilanova e Silva		OK
Matheus Pereira Fernandes		OK
Mayara		errado
Melissa K. Alves		alguns conceitos errados mas OK
Michelle Catelan		OK
Murillo Lovaglio		OK
Murilo da Silva Lima		errado
Natasha Linhares		muito incompleto/não pontuou
nathália Bernardes Ribeiro		OK
Nathália Mota P. V. Ribeiro		OK
Nelson Zacaner		alguns conceitos errados mas OK
Nicolas Braga Casarin		alguns conceitos errados mas OK
Nilo Rosseti		muito incompleto/não pontuou
Paulo Victor Bertola		OK
Pedro		alguns conceitos errados mas OK
Pedro  Lahr		alguns conceitos errados mas OK
Pedro Abilio Antonelli Neto		OK
Pedro Henrique Alves Pereira		muito incompleto/não pontuou
Pedro Henrique Pereira		OK
Pedro Silvestre de Lima		muito incompleto/não pontuou
Rafael Azevedo Borges		muito incompleto/não pontuou
Rafaella Mazza		alguns conceitos errados mas OK
Ramon Caria		OK
Renan Antonio Roma		OK
Renato	???	OK
Renato Alexandre Cunha		OK
Ricardo Luiz Cezario Gonçalves		muito incompleto/não pontuou
Rodolfo Augusto Maniero		OK
Rodrigo Iwata Fujiwara		OK
Sara Sabrina Silva		Fora do prazo/ invalidado
Sergio Figueiredo Angolini		muito incompleto/não pontuou
Tania Carvalho Carli		Fora do prazo/ invalidado
Tati	????	OK, mas quem é vc?
Tiago Graciano de Biasi		alguns conceitos errados mas OK
Vanessa Ribeiro		OK
Victor Hugo Cristino Torraca		muito incompleto/não pontuou
Vitor Lacorte		OK
Vitor Pimenta Pereira		OK
Vitor yuji ochibuko		muito incompleto/não pontuou
Yago Alves Lima Prezotto		OK
Yohana Cunha de Melo		OK
Yung Jin Lee		Fora do prazo/ invalidado

Aulas Prática 4 e 5 - Bactérias gram positiva, motilidade

Olá pessoal!

     Na aula prática continuamos a visualização de bactérias. Realizamos um teste de coloração direta chamado Coloração diferencial de gram e através deste teste podemos separar as bactérias em dois grandes grupos, gram positivo e gram negativo. Esta técnica foi criada em 1884 pelo médico dinamarquês Christian Gram e até hoje é muito utilizada. A diferença entre as bactéricas gram positivas e gram negativas está na parede celular. As  bactérias gram positivas não possuem uma membrana externa e possuem uma camada enorme de peptideoglicano, já as gram negativas possuem membrana externa mas sua camada de peptideoglicano é bem fina. A espessura da parede das gram + é quase o dobro das gram - além de também possuírem um peso seco muito maior. Outras diferenças é em função de susceptibilidade a antibióticos, as gram positivas são resistentes a estreptomicina e tetraciclina e suscetíveis a penicilina já para as gram negativas é o oposto.

Parede celular de bactérias Gram positivo e Gram negativo.

A seguir vamos descrever passo a passo a coloração diferencial de Gram e explicaremos o que ocorre:

1. Fazer um esfregaço da suspensão bacteriana na lamina de vidro e fixar através do calor.
2. Cobrir o esfregaço com cristal violeta por 1 minuto. Neste momento todas as bactérias adquirem coloração violeta.
3. Lavar com água e cobrir o esfregaço com solução de iodo por 30 segundos. A solução de iodo vai fixar a coloração dentro das bactérias.
4. Lavar com álcool. Neste momento o álcool dissolve os lipídeos da parede celular da bactéria gram negativa e com isso a coloração violeta sai destas bactérias, enquanto que na gram positiva o álcool faz com que os poros na camada de peptideoglucano se fechem.
5. Cobrir o esfregaço com safranina por 1 minuto. Este corante vai corar as bactérias que perderam a coloração violeta na lavagem com o álcool e a safranina não consegue entrar nas células que já possuem o cristal violeta em seu interior pois seus poros estão fechados.
6. Lavar com água, secar e observar

Então, ao observarmos a lâmina, se as bactérias que possuírem uma coloração violeta são gram positivas e as bactérias que possuírem coloração avermelhada são gram negativas.

        Após a lâmina de gram fizemos uma lâmina que é capaz de detectar a motilidade bacteriana. Verificar a motilidade de uma bactéria é um indício da presença de flagelos. Esta técnica se chama "gota pendente", é muito simples de se fazer:

1. Colocar uma gota da suspensão bacteriana em uma lamínula
2. inverter a lamínula e colocá-la sobre a lâmina (esta lâmina precisa ter uma concavidade), de tal maneira que a gota fique pendente no centro da área côncava
3. observar ao microscópio

No caso da ausência de flagelo as células estarão paradas, mas caso existam flagelos as bactérias estarão se movimentando, vocês devem visualizar algo semelhante a este vídeo: http://www.youtube.com/watch?v=sxlbGQHqD34 Esta técnica finaliza nossas aulas sobre procariotos!
         

         Pessoal por enquanto ficamos por aqui, qualquer dúvida só deixar um comentário que responderemos! Bons estudos!

Até

Raphael/Aranha

Aula Prática 3 - Visualização de Bactérias

Olá pessoal,

Na aula prática desta semana iniciamos o capítulo de coloração e motilidade de bactérias (pág. 11 da apostila) e vimos sobre métodos de coloração simples. Como são microrganismos diminutos, necessitam ser contrastados para que sua forma seja evidenciada. Utilizamos duas técnicas para visualização de bactérias, a coloração direta ou positiva e a coloração indireta ou negativa.

Primeiro vamos falar da coloração direta ou positiva, que recebe este nome pois é a bactéria quem fica corada. É uma coloração rápida que utiliza quatro etapas: 

1- fazer um esfregaço da suspensão bacteriana na lâmina de vidro

2- fixar o esfregaço na lâmina através do calor

3- cobrir o esfregaço com o corante (safranina ou fuccina) por 30 segundos a um minuto

4- lavar gentilmente a lâmina com água, secar com o calor e observar

Este protocolo está na página 13 da apostila de microbiologia.

                                         

Em seguida fizemos a coloração negativa ou indireta, onde ao invés da bactéria, a lâmina é que é corada. Utilizamos o seguinte protocolo: 

1 - fazer um esfregaço da suspensão bacteriana na lâmina de vidro
2-  fixar o esfregaço na lâmina através do calor

3- colocar uma gota do corante (Nanquim) em uma extremidade da lâmina, distante do esfregaço
4- com o auxílio de outra lâmina, na posição inclinada, arrastar o Nanquim sobre o esfregaço, de tal maneira que forme uma película bem fina do corante
5- secar no ar e observar

Este protocolo está na página 14 da apostila de microbiologia.

      Durante as visualizações, utilizamos uma suspensão bacteriana de Bacillus subtilis, uma bactéria saprófita comum do solo e da água. Estes bacilos foram utilizados em pesquisa pelo pelo Departamento de Defesa dos EUA, no “Projeto SHAD” – envolvido em armas químicas e biológicas, durante o período da guerra fria. A indústria utiliza algumas das enzimas que ela produz em detergentes de limpeza.

 Até a semana que vem!

Raphael/Aranha

Aulas 4 e 5 - Procariotos, biologia e importância econômica

Olá Pessoal,

      Como vimos na última aula, nem tudo que aprendemos no ensino médio é 100% verdadeiro. A árvore de Whittaker partia do ancestral comum entre eucariotos e procariotos e então seguiria a diversidade de organimos, relembrando que o grupo Archaea estava dentro dos procariotos. Foi então que Woese em 1977, através do uso do cronometro evolutivo, mostrou que a partir de um mesmo ancestral comum se separavam três domínios: Eukarya, Bacteria e Archaea. Atualmente é aceito pela comunidade científica que este ancestral comum provavelmente era um organimo similar a uma Archaea.  Isto se deve ao fato das arqueas viverem em ambientes que eram os que prevaleciam na Terra primitiva.                                                  

Woese

     Um dos principais focos de estudo em fósseis de microrganismos fica em Shark Bay na Austrália em função das formações rochosas que lá existem. Essas formações são os estromatólitos, que são formados por uma base de calcário produzido por microrganismos e então formam colunas no fundo de mares rasos que vai se acumulando até formar uma espécie de recife. Estas estruturas podem datar até 3,8 bilhões de anos, mostrando que mesmo nas condições adversas da atmosfera primitiva já existiam microrganismos. Apesar sua baixa diversidade morfológica (cocos, bacilos e espiralados), estes seres possuem uma grande diversidade genética. Em aula, falamos que isto é um paradoxo: se tem grande diversidade genética, era de se esperar grande diversidade morfológica. Em eucariotos a situação é o contrário: a diversidade genética não é tão alta quanto entre procariotos porém a morfológica sim. Isto nos mostra que a seleção natural atuou de tal maneira a não permitir grandes variações na célula de procariotos. As formas celulares atuais são as que permitem manter elevadas taxas metabólicas e se adaptar a inúmeros nichos. Lembre-se: uma célula de Escherichia coli se multiplica a cada 15-20 minutos!!!

Shark bay - estromatólitos

       Agora que nos situamos na diversidade genética, quais são as principais diferenças entre eucariotos e procariotos? Vamos começar pelo próprio nome, os procariotos não possuem carioteca, ou seja, a membrana que envolve o núcleo, portanto o mesmo não é organizado. Os procariotos também não tem organelas celulares. Outra diferença é em relação ao cromossomo, no caso dos procariotos ele é único e circular (com exceções) e os eucariotos possuem vários e lineares. Porém, os procariotos possuem plasmídeos que os eucariotos não possuem. O plasmídeo é um mini cromossomo que é dispensável e pode ser trocado entre indivíduos. Por fim, mas não menos importante, são seus meios de variabilidade genética, os eucariotos contam com a meiose e os procariotos possuem três meios de variabilidade: conjugação, transformação e transdução. Além da mutação que é um mecanismo evolutivo que todos os seres possuem.

Conjugação

Transdução

         A conjugação é um mecanismo de variabilidade onde uma bactéria "macho", bactéria que produz um pêlo sexual (sex pilus), encontra com uma bactéria "fêmea". O macho envia uma cópia do seu plasmídeo para a fêmea fazendo com que ela possua novos genes. A transformação ocorre através da captura de fragmentos que estão soltos no ar e então estes são inseridos dentro do plasmídeo. A transdução acontece por intermédio de um vírus. O vírus infecta a bactéria e se multiplica e ocasionalmente uma nova capsula viral acaba armazenando um pedaço do cromossomo dessa bactéria hospedeira prestes a morrer. Esta vírus acaba infectando outra bactéria e ao invés de causar a morte da mesma, transmite um fragmento do DNA da antiga hospedeira que se insere em seu cromossomo.

              Mas neste contexto como ficam as Archaeas? Elas são mais próximas aos eucariotos ou procariotos? Já sabemos que em relação à sequência do gene que codifica o RNA ribossomal ela é diferente de ambos e agora vamos ver um pouco sobre suas características. Primeiramente, elas possuem parede celular assim como as bactérias, porém sua composição é muito variada, diferentemente das bactérias que possuem a parede celular de peptideoglicano. Outra semelhança com as bactérias é o alto conteúdo protéico da membrana plasmática que se opõe ao dos eucariotos, que é baixo. Eucariotos e bactérias possuem fosfolipídeos na membrana, enquanto que Archaeas possuem uma composição lipídica variada. Outra característica importante é a estrutura e ligação dos lipídeos da membrana: o domínio bactéria e eukarya possuem uma cadeia linear enquanto que Archaeas possuem sua cadeia ramificada. A ligação lípidica de bactéria e eukarya é éster enquanto que Archaea é éter. Outra semelhança entre Archaea e Eukarya são as histonas que protegem o DNA. São características muito importantes que mostram o quão diferentes são estes domínios e também porque as Archaeas não podem ser inseridas nem em um grupo e nem um outro, tendo um domínio só para ela.

Rhizobium

    Apesar da importância das arqueas, poucos exemplos fazem ligação direta com Florestal e Agronomia. Mas isto é reflexo de nosso pouco conhecimento sobre elas e isto deve mudar no futuro. Já no caso das bactérias, sua importância direta é ampla! Existem bactérias fitopatogênicas (gram positiva e negativa, mais detalhado no resumo da aula prática), simbióticas (fixação de nitrogênio), entéricas e esporogênicas (infecção e intoxicação alimentar). Estes assuntos serão vistos um pouco mais em detalhes mais para o final do curso, justamente para fazermos uma ligação com as disciplinas que vcs cursarão no futuro. Aí, se vc gostou dos procariotos e quiser trabalhar com eles no futuro, saberá em quais áreas vc poderá auar como  florestal ou do agrônomo. Aqui vão algumas: controle biológicos de pragas; fitopatologia; fermentações alimentícias; segurança alimentar; associações simbióticas entre plantas e microorganismos, fisiologia do rúmen, e por aí vai...
  

Até a próxima aula

Raphael/Aranha

        























     
     

resultados de pesquisas

Olá Pessoal

Por favor, NÃO mandem suas pesquisas para meu email. Vcs devem posta-las como comentários no blog. Há instruções sobre como fazer isto se vc não souber. Pesquisas enviadas ao meu email não serão consideradas.

faltam duas horas para o fim do recebimento das pesquisas sobre arqueas.

abcs

Aranha

Pesquisa sobre Archaea - 0,5 ponto na primeira prova

Boa noite

Seguinte! Na próxima aula veremos as características que diferem arqueas de bactérias. Mas se vc fizer uma pesquisa e me adiantar quais são estas diferenças vc leva 0,5 ponto na primeira prova! Simples assim. Faça sua postagem até segunda, dia 19, as 24 horas. Depois disto, nada feito, pois já será o dia da aula... Me traga ao menos umas três diferenças bem explicadas!

abraços e boa pesquisa.

Aranha